Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLIT2O94813 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLIT2O94813 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLIT2O94813 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLIT2O94813 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLIT2O94813 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms