Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN1O60240 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms