Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms