Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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