Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GOLGA8SH3BPF8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms