Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN25C9JDP6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms