Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms