Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms