Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms