Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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