Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED16Q9Y2X0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms