Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms