Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms