Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms