Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms