Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms