Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms