Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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RABGEF1Q9UJ41 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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RABGEF1Q9UJ41 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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RABGEF1Q9UJ41 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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RABGEF1Q9UJ41 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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RABGEF1Q9UJ41 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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RABGEF1Q9UJ41 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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