Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD1Q9UIS9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms