Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms