Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MLH3Q9UHC1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms