Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms