Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms