Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCDH10Q9P2E7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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