Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHRF1Q9P1Y6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms