Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDAP2Q9NXN4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms