Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms