Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms