Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms