Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F12Q9HCS2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms