Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHACTR1Q9C0D0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms