Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CIPCQ9C0C6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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