Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms