Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIOK2Q9BVS4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms