Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms