Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF4Q9BUZ4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms