Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms