Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms