Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms