Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGIP1Q9BQI5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms