Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GFI1Q99684 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GFI1Q99684 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GFI1Q99684 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GFI1Q99684 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GFI1Q99684 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GFI1Q99684 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GFI1Q99684 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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