Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHP1Q99653 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms