Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms