Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRNP1Q96S65 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRNP1Q96S65 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms