Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms