Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL15Q96M94 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms