Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms