Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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