Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD3Q96L08 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms