Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
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